Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD17

ZNF398, Zinc finger protein 398, humanhuman

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Length 642 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF398Q8TD17 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ZNF398Q8TD17 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF398Q8TD17 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF398Q8TD17 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF398Q8TD17 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF398Q8TD17 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF398Q8TD17 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF398Q8TD17 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF398Q8TD17 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF398Q8TD17 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF398Q8TD17 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF398Q8TD17 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF398Q8TD17 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF398Q8TD17 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF398Q8TD17 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF398Q8TD17 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF398Q8TD17 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF398Q8TD17 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF398Q8TD17 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF398Q8TD17 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF398Q8TD17 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF398Q8TD17 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF398Q8TD17 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF398Q8TD17 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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