Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBA3Q8TBC4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBA3Q8TBC4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms