Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI35

PATJ, InaD-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATJQ8NI35 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PATJQ8NI35 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PATJQ8NI35 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PATJQ8NI35 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PATJQ8NI35 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PATJQ8NI35 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PATJQ8NI35 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PATJQ8NI35 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PATJQ8NI35 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PATJQ8NI35 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PATJQ8NI35 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PATJQ8NI35 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PATJQ8NI35 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PATJQ8NI35 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PATJQ8NI35 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PATJQ8NI35 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PATJQ8NI35 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PATJQ8NI35 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PATJQ8NI35 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PATJQ8NI35 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PATJQ8NI35 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PATJQ8NI35 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PATJQ8NI35 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PATJQ8NI35 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PATJQ8NI35 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PATJQ8NI35 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PATJQ8NI35 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PATJQ8NI35 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PATJQ8NI35 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PATJQ8NI35 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PATJQ8NI35 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PATJQ8NI35 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PATJQ8NI35 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PATJQ8NI35 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PATJQ8NI35 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PATJQ8NI35 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PATJQ8NI35 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PATJQ8NI35 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PATJQ8NI35 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PATJQ8NI35 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PATJQ8NI35 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PATJQ8NI35 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms