Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TTLL11Q8NHH1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TTLL11Q8NHH1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TTLL11Q8NHH1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TTLL11Q8NHH1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TTLL11Q8NHH1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TTLL11Q8NHH1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TTLL11Q8NHH1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TTLL11Q8NHH1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TTLL11Q8NHH1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TTLL11Q8NHH1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TTLL11Q8NHH1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TTLL11Q8NHH1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TTLL11Q8NHH1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TTLL11Q8NHH1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TTLL11Q8NHH1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTLL11Q8NHH1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTLL11Q8NHH1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTLL11Q8NHH1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTLL11Q8NHH1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTLL11Q8NHH1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTLL11Q8NHH1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTLL11Q8NHH1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTLL11Q8NHH1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTLL11Q8NHH1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTLL11Q8NHH1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTLL11Q8NHH1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTLL11Q8NHH1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TTLL11Q8NHH1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms