Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LINC00116Q8NCU8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LINC00116Q8NCU8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms