Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMEM35BQ8NCS4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM35BQ8NCS4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms