Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPRYD3Q8NCJ5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPRYD3Q8NCJ5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPRYD3Q8NCJ5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPRYD3Q8NCJ5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPRYD3Q8NCJ5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPRYD3Q8NCJ5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPRYD3Q8NCJ5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPRYD3Q8NCJ5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPRYD3Q8NCJ5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPRYD3Q8NCJ5 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPRYD3Q8NCJ5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPRYD3Q8NCJ5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPRYD3Q8NCJ5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPRYD3Q8NCJ5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPRYD3Q8NCJ5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPRYD3Q8NCJ5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SPRYD3Q8NCJ5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPRYD3Q8NCJ5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPRYD3Q8NCJ5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPRYD3Q8NCJ5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPRYD3Q8NCJ5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms