Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPC24Q8NBT2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPC24Q8NBT2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms