Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP38Q8NB14 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP38Q8NB14 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms