Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NME8Q8N427 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NME8Q8N427 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NME8Q8N427 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NME8Q8N427 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NME8Q8N427 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NME8Q8N427 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NME8Q8N427 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NME8Q8N427 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NME8Q8N427 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NME8Q8N427 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NME8Q8N427 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NME8Q8N427 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NME8Q8N427 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NME8Q8N427 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NME8Q8N427 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NME8Q8N427 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NME8Q8N427 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NME8Q8N427 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NME8Q8N427 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NME8Q8N427 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NME8Q8N427 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NME8Q8N427 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NME8Q8N427 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NME8Q8N427 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NME8Q8N427 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NME8Q8N427 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NME8Q8N427 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NME8Q8N427 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
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