Protein–RNA interactions for Protein: Q8N144

GJD3, Gap junction delta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD3Q8N144 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJD3Q8N144 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJD3Q8N144 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJD3Q8N144 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJD3Q8N144 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJD3Q8N144 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GJD3Q8N144 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJD3Q8N144 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJD3Q8N144 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJD3Q8N144 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJD3Q8N144 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJD3Q8N144 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJD3Q8N144 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJD3Q8N144 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GJD3Q8N144 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms