Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMYD4Q8IYR2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMYD4Q8IYR2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms