Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYM1

SEPT12, Septin-12, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT12Q8IYM1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SEPT12Q8IYM1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SEPT12Q8IYM1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SEPT12Q8IYM1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SEPT12Q8IYM1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SEPT12Q8IYM1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SEPT12Q8IYM1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SEPT12Q8IYM1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SEPT12Q8IYM1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SEPT12Q8IYM1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEPT12Q8IYM1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SEPT12Q8IYM1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SEPT12Q8IYM1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SEPT12Q8IYM1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SEPT12Q8IYM1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SEPT12Q8IYM1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SEPT12Q8IYM1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SEPT12Q8IYM1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SEPT12Q8IYM1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SEPT12Q8IYM1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SEPT12Q8IYM1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SEPT12Q8IYM1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SEPT12Q8IYM1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEPT12Q8IYM1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEPT12Q8IYM1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SEPT12Q8IYM1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEPT12Q8IYM1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEPT12Q8IYM1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SEPT12Q8IYM1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEPT12Q8IYM1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms