Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUX4

APOBEC3F, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3FQ8IUX4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
APOBEC3FQ8IUX4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
APOBEC3FQ8IUX4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
APOBEC3FQ8IUX4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
APOBEC3FQ8IUX4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
APOBEC3FQ8IUX4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBEC3FQ8IUX4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBEC3FQ8IUX4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBEC3FQ8IUX4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBEC3FQ8IUX4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBEC3FQ8IUX4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBEC3FQ8IUX4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBEC3FQ8IUX4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBEC3FQ8IUX4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBEC3FQ8IUX4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBEC3FQ8IUX4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBEC3FQ8IUX4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBEC3FQ8IUX4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBEC3FQ8IUX4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBEC3FQ8IUX4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBEC3FQ8IUX4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APOBEC3FQ8IUX4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms