Protein–RNA interactions for Protein: Q86Y13

DZIP3, E3 ubiquitin-protein ligase DZIP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DZIP3Q86Y13 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DZIP3Q86Y13 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DZIP3Q86Y13 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DZIP3Q86Y13 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DZIP3Q86Y13 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DZIP3Q86Y13 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DZIP3Q86Y13 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DZIP3Q86Y13 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DZIP3Q86Y13 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DZIP3Q86Y13 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DZIP3Q86Y13 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DZIP3Q86Y13 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DZIP3Q86Y13 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DZIP3Q86Y13 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DZIP3Q86Y13 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DZIP3Q86Y13 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DZIP3Q86Y13 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DZIP3Q86Y13 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DZIP3Q86Y13 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DZIP3Q86Y13 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
DZIP3Q86Y13 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DZIP3Q86Y13 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
DZIP3Q86Y13 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
DZIP3Q86Y13 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DZIP3Q86Y13 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DZIP3Q86Y13 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DZIP3Q86Y13 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DZIP3Q86Y13 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
DZIP3Q86Y13 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DZIP3Q86Y13 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DZIP3Q86Y13 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DZIP3Q86Y13 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DZIP3Q86Y13 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DZIP3Q86Y13 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
DZIP3Q86Y13 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DZIP3Q86Y13 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DZIP3Q86Y13 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DZIP3Q86Y13 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DZIP3Q86Y13 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DZIP3Q86Y13 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms