Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC6BQ86SZ2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAPPC6BQ86SZ2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
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