Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6E9

RBBP6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6Q7Z6E9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBBP6Q7Z6E9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBBP6Q7Z6E9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBBP6Q7Z6E9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBBP6Q7Z6E9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBBP6Q7Z6E9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBBP6Q7Z6E9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms