Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTN6

STRADA, STE20-related kinase adapter protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADAQ7RTN6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
STRADAQ7RTN6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRADAQ7RTN6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms