Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYDE1Q6ZW31 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYDE1Q6ZW31 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms