Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMIGD1Q6UXZ0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms