Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMBR1LQ6UX01 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMBR1LQ6UX01 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMBR1LQ6UX01 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMBR1LQ6UX01 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMBR1LQ6UX01 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMBR1LQ6UX01 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMBR1LQ6UX01 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LMBR1LQ6UX01 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMBR1LQ6UX01 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMBR1LQ6UX01 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMBR1LQ6UX01 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMBR1LQ6UX01 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMBR1LQ6UX01 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms