Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMCO3Q6UWJ1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMCO3Q6UWJ1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
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