Protein–RNA interactions for Protein: Q6RI45

BRWD3, Bromodomain and WD repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRWD3Q6RI45 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC28■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BRWD3Q6RI45 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms