Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNY1

BLOC1S2, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLOC1S2Q6QNY1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BLOC1S2Q6QNY1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BLOC1S2Q6QNY1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms