Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF7Q6Q0C0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF7Q6Q0C0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms