Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJF5

RHBDF2, Inactive rhomboid protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF2Q6PJF5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDF2Q6PJF5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDF2Q6PJF5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDF2Q6PJF5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDF2Q6PJF5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDF2Q6PJF5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDF2Q6PJF5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDF2Q6PJF5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDF2Q6PJF5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDF2Q6PJF5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDF2Q6PJF5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDF2Q6PJF5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDF2Q6PJF5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDF2Q6PJF5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDF2Q6PJF5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDF2Q6PJF5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDF2Q6PJF5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDF2Q6PJF5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDF2Q6PJF5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDF2Q6PJF5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDF2Q6PJF5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDF2Q6PJF5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDF2Q6PJF5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDF2Q6PJF5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDF2Q6PJF5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDF2Q6PJF5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDF2Q6PJF5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDF2Q6PJF5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDF2Q6PJF5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDF2Q6PJF5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDF2Q6PJF5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDF2Q6PJF5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDF2Q6PJF5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDF2Q6PJF5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDF2Q6PJF5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDF2Q6PJF5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDF2Q6PJF5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDF2Q6PJF5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDF2Q6PJF5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDF2Q6PJF5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDF2Q6PJF5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDF2Q6PJF5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDF2Q6PJF5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDF2Q6PJF5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDF2Q6PJF5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDF2Q6PJF5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RHBDF2Q6PJF5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RHBDF2Q6PJF5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms