Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EFCAB12Q6NXP0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EFCAB12Q6NXP0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms