Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOBEC3HQ6NTF7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOBEC3HQ6NTF7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms