Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTE8

MRNIP, MRN complex-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRNIPQ6NTE8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
MRNIPQ6NTE8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms