Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPPQ6IPU0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPPQ6IPU0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms