Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CARMIL2Q6F5E8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CARMIL2Q6F5E8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CARMIL2Q6F5E8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CARMIL2Q6F5E8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CARMIL2Q6F5E8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CARMIL2Q6F5E8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CARMIL2Q6F5E8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CARMIL2Q6F5E8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CARMIL2Q6F5E8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CARMIL2Q6F5E8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CARMIL2Q6F5E8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
CARMIL2Q6F5E8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CARMIL2Q6F5E8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CARMIL2Q6F5E8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CARMIL2Q6F5E8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CARMIL2Q6F5E8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CARMIL2Q6F5E8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CARMIL2Q6F5E8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CARMIL2Q6F5E8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CARMIL2Q6F5E8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CARMIL2Q6F5E8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CARMIL2Q6F5E8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CARMIL2Q6F5E8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CARMIL2Q6F5E8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CARMIL2Q6F5E8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
CARMIL2Q6F5E8 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
CARMIL2Q6F5E8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CARMIL2Q6F5E8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CARMIL2Q6F5E8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CARMIL2Q6F5E8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
CARMIL2Q6F5E8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
CARMIL2Q6F5E8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
CARMIL2Q6F5E8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CARMIL2Q6F5E8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CARMIL2Q6F5E8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CARMIL2Q6F5E8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CARMIL2Q6F5E8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CARMIL2Q6F5E8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CARMIL2Q6F5E8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CARMIL2Q6F5E8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CARMIL2Q6F5E8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CARMIL2Q6F5E8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CARMIL2Q6F5E8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CARMIL2Q6F5E8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CARMIL2Q6F5E8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CARMIL2Q6F5E8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CARMIL2Q6F5E8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CARMIL2Q6F5E8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CARMIL2Q6F5E8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CARMIL2Q6F5E8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CARMIL2Q6F5E8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CARMIL2Q6F5E8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CARMIL2Q6F5E8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
CARMIL2Q6F5E8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CARMIL2Q6F5E8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CARMIL2Q6F5E8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CARMIL2Q6F5E8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CARMIL2Q6F5E8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CARMIL2Q6F5E8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CARMIL2Q6F5E8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CARMIL2Q6F5E8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CARMIL2Q6F5E8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CARMIL2Q6F5E8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CARMIL2Q6F5E8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CARMIL2Q6F5E8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CARMIL2Q6F5E8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CARMIL2Q6F5E8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CARMIL2Q6F5E8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CARMIL2Q6F5E8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CARMIL2Q6F5E8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
CARMIL2Q6F5E8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CARMIL2Q6F5E8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CARMIL2Q6F5E8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CARMIL2Q6F5E8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CARMIL2Q6F5E8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CARMIL2Q6F5E8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CARMIL2Q6F5E8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CARMIL2Q6F5E8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CARMIL2Q6F5E8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CARMIL2Q6F5E8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CARMIL2Q6F5E8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CARMIL2Q6F5E8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
CARMIL2Q6F5E8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
CARMIL2Q6F5E8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CARMIL2Q6F5E8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CARMIL2Q6F5E8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CARMIL2Q6F5E8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
CARMIL2Q6F5E8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CARMIL2Q6F5E8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CARMIL2Q6F5E8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CARMIL2Q6F5E8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CARMIL2Q6F5E8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CARMIL2Q6F5E8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CARMIL2Q6F5E8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CARMIL2Q6F5E8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CARMIL2Q6F5E8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CARMIL2Q6F5E8 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CARMIL2Q6F5E8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CARMIL2Q6F5E8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms