Protein–RNA interactions for Protein: Q5T890

ERCC6L2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6L2Q5T890 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ERCC6L2Q5T890 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ERCC6L2Q5T890 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ERCC6L2Q5T890 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ERCC6L2Q5T890 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ERCC6L2Q5T890 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
ERCC6L2Q5T890 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ERCC6L2Q5T890 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
ERCC6L2Q5T890 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ERCC6L2Q5T890 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ERCC6L2Q5T890 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ERCC6L2Q5T890 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ERCC6L2Q5T890 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ERCC6L2Q5T890 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ERCC6L2Q5T890 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
ERCC6L2Q5T890 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ERCC6L2Q5T890 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ERCC6L2Q5T890 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ERCC6L2Q5T890 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ERCC6L2Q5T890 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ERCC6L2Q5T890 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
ERCC6L2Q5T890 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ERCC6L2Q5T890 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ERCC6L2Q5T890 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ERCC6L2Q5T890 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ERCC6L2Q5T890 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ERCC6L2Q5T890 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ERCC6L2Q5T890 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ERCC6L2Q5T890 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ERCC6L2Q5T890 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ERCC6L2Q5T890 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
ERCC6L2Q5T890 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ERCC6L2Q5T890 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
ERCC6L2Q5T890 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ERCC6L2Q5T890 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ERCC6L2Q5T890 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
ERCC6L2Q5T890 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ERCC6L2Q5T890 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
ERCC6L2Q5T890 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ERCC6L2Q5T890 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ERCC6L2Q5T890 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ERCC6L2Q5T890 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ERCC6L2Q5T890 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ERCC6L2Q5T890 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ERCC6L2Q5T890 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ERCC6L2Q5T890 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ERCC6L2Q5T890 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
ERCC6L2Q5T890 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ERCC6L2Q5T890 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ERCC6L2Q5T890 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ERCC6L2Q5T890 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ERCC6L2Q5T890 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ERCC6L2Q5T890 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ERCC6L2Q5T890 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ERCC6L2Q5T890 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ERCC6L2Q5T890 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ERCC6L2Q5T890 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ERCC6L2Q5T890 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ERCC6L2Q5T890 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ERCC6L2Q5T890 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ERCC6L2Q5T890 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ERCC6L2Q5T890 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ERCC6L2Q5T890 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ERCC6L2Q5T890 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
ERCC6L2Q5T890 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ERCC6L2Q5T890 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ERCC6L2Q5T890 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ERCC6L2Q5T890 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ERCC6L2Q5T890 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ERCC6L2Q5T890 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ERCC6L2Q5T890 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ERCC6L2Q5T890 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ERCC6L2Q5T890 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ERCC6L2Q5T890 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ERCC6L2Q5T890 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ERCC6L2Q5T890 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ERCC6L2Q5T890 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ERCC6L2Q5T890 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
ERCC6L2Q5T890 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.05
ERCC6L2Q5T890 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ERCC6L2Q5T890 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ERCC6L2Q5T890 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
ERCC6L2Q5T890 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ERCC6L2Q5T890 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ERCC6L2Q5T890 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ERCC6L2Q5T890 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ERCC6L2Q5T890 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ERCC6L2Q5T890 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ERCC6L2Q5T890 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ERCC6L2Q5T890 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
ERCC6L2Q5T890 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ERCC6L2Q5T890 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ERCC6L2Q5T890 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ERCC6L2Q5T890 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ERCC6L2Q5T890 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ERCC6L2Q5T890 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ERCC6L2Q5T890 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ERCC6L2Q5T890 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ERCC6L2Q5T890 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ERCC6L2Q5T890 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms