Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BEND3Q5T5X7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BEND3Q5T5X7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BEND3Q5T5X7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BEND3Q5T5X7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BEND3Q5T5X7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
BEND3Q5T5X7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
BEND3Q5T5X7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BEND3Q5T5X7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BEND3Q5T5X7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
BEND3Q5T5X7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BEND3Q5T5X7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BEND3Q5T5X7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BEND3Q5T5X7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BEND3Q5T5X7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BEND3Q5T5X7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BEND3Q5T5X7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BEND3Q5T5X7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BEND3Q5T5X7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BEND3Q5T5X7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BEND3Q5T5X7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BEND3Q5T5X7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BEND3Q5T5X7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BEND3Q5T5X7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BEND3Q5T5X7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BEND3Q5T5X7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BEND3Q5T5X7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BEND3Q5T5X7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BEND3Q5T5X7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
BEND3Q5T5X7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BEND3Q5T5X7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BEND3Q5T5X7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BEND3Q5T5X7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BEND3Q5T5X7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BEND3Q5T5X7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BEND3Q5T5X7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BEND3Q5T5X7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BEND3Q5T5X7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BEND3Q5T5X7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BEND3Q5T5X7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BEND3Q5T5X7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BEND3Q5T5X7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
BEND3Q5T5X7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
BEND3Q5T5X7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BEND3Q5T5X7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BEND3Q5T5X7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BEND3Q5T5X7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BEND3Q5T5X7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BEND3Q5T5X7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BEND3Q5T5X7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BEND3Q5T5X7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BEND3Q5T5X7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BEND3Q5T5X7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BEND3Q5T5X7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BEND3Q5T5X7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
BEND3Q5T5X7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BEND3Q5T5X7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BEND3Q5T5X7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BEND3Q5T5X7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BEND3Q5T5X7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BEND3Q5T5X7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BEND3Q5T5X7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BEND3Q5T5X7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BEND3Q5T5X7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BEND3Q5T5X7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BEND3Q5T5X7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BEND3Q5T5X7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BEND3Q5T5X7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BEND3Q5T5X7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BEND3Q5T5X7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BEND3Q5T5X7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BEND3Q5T5X7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BEND3Q5T5X7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BEND3Q5T5X7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BEND3Q5T5X7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BEND3Q5T5X7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BEND3Q5T5X7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BEND3Q5T5X7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BEND3Q5T5X7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BEND3Q5T5X7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BEND3Q5T5X7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BEND3Q5T5X7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BEND3Q5T5X7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BEND3Q5T5X7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BEND3Q5T5X7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BEND3Q5T5X7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BEND3Q5T5X7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BEND3Q5T5X7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BEND3Q5T5X7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BEND3Q5T5X7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BEND3Q5T5X7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BEND3Q5T5X7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BEND3Q5T5X7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BEND3Q5T5X7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BEND3Q5T5X7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BEND3Q5T5X7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BEND3Q5T5X7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BEND3Q5T5X7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BEND3Q5T5X7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
BEND3Q5T5X7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms