Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC183Q5T5S1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms