Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4F4

ZFYVE27, Protrudin, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE27Q5T4F4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZFYVE27Q5T4F4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms