Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0T0

MARCH8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH8Q5T0T0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MARCH8Q5T0T0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MARCH8Q5T0T0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms