Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COLEC12Q5KU26 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COLEC12Q5KU26 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms