Protein–RNA interactions for Protein: Q5JU00

TCTE1, T-complex-associated testis-expressed protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTE1Q5JU00 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCTE1Q5JU00 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCTE1Q5JU00 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms