Protein–RNA interactions for Protein: Q5JT25

RAB41, Ras-related protein Rab-41, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB41Q5JT25 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB41Q5JT25 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms