Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL39P5Q59GN2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms