Protein–RNA interactions for Protein: Q53GS7

GLE1, Nucleoporin GLE1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLE1Q53GS7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLE1Q53GS7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLE1Q53GS7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLE1Q53GS7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLE1Q53GS7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLE1Q53GS7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLE1Q53GS7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLE1Q53GS7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLE1Q53GS7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GLE1Q53GS7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLE1Q53GS7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms