Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SVEP1Q4LDE5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms