Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP221Q4G0U5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP221Q4G0U5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms