Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC153Q494R4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC153Q494R4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC153Q494R4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC153Q494R4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC153Q494R4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms