Protein–RNA interactions for Protein: Q3E827

LSO1, Protein LSO1, yeastyeast

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSO1Q3E827 DIB1YPR082C 432 nt5.07□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 ATG12YBR217W 561 nt5.07□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 MUD2YKL074C 1584 nt5.07□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 SEC2YNL272C 2280 nt5.07□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 PHO84YML123C 1764 nt5.06□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 SUP35YDR172W 2058 nt5.06□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 TEF1YPR080W 1377 nt5.06□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 TEF2YBR118W 1377 nt5.06□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 YRA1YDR381W 681 nt5.06□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 MRM2YGL136C 963 nt5.06□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 YKL069WYKL069W 543 nt5.06□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 RPS1AYLR441C 768 nt5.06□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 TIF11YMR260C 462 nt5.06□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 YOR053WYOR053W 342 nt5.06□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 YOR203WYOR203W 354 nt5.06□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 MRPL40YPL173W 894 nt5.06□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 CMD1YBR109C 444 nt5.06□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 AIM4YBR194W 372 nt5.06□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 MRK1YDL079C 1506 nt5.06□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 ATM1YMR301C 2073 nt5.06□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 TRM44YPL030W 1704 nt5.06□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 CTT1YGR088W 1689 nt5.05□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 RPN3YER021W 1572 nt5.05□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 BLM10YFL007W 6432 nt5.05□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 YDR115WYDR115W 318 nt5.05□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 YIR020CYIR020C 303 nt5.05□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 AIM29YKR074W 468 nt5.05□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 RFU1YLR073C 603 nt5.05□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 YLR101CYLR101C 396 nt5.05□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 YPL107WYPL107W 747 nt5.05□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 TPK2YPL203W 1143 nt5.05□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt5.05□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 DER1YBR201W 636 nt5.05□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 snR54snR54 86 nt5.05□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 TIF4632YGL049C 2745 nt5.05□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 YMR196WYMR196W 3267 nt5.04□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 MCH4YOL119C 1506 nt5.04□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 NNK1YKL171W 2787 nt5.04□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 SWF1YDR126W 1011 nt5.04□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 MFA1YDR461W 111 nt5.04□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 YER046W-AYER046W-A 330 nt5.04□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 SPT2YER161C 1002 nt5.04□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 YGL039WYGL039W 1047 nt5.04□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 AML1YGR001C 747 nt5.04□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 VMA10YHR039C-A 345 nt5.04□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 SAE3YHR079C-A 276 nt5.04□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 ADY2YCR010C 852 nt5.03□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt5.03□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 RTS3YGR161C 792 nt5.03□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 RPS20YHL015W 366 nt5.03□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 ENT3YJR125C 1227 nt5.03□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 YKL044WYKL044W 321 nt5.03□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 RPL40BYKR094C 387 nt5.03□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 ERG3YLR056W 1098 nt5.03□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 SWM2YNR004W 441 nt5.03□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 OPY2YPR075C 1083 nt5.03□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 MSS18YPR134W 807 nt5.03□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 EXO5YBR163W 1758 nt5.03□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 OAF1YAL051W 3144 nt5.03□□□□□ -1.6
LSO1Q3E827 HIR2YOR038C 2628 nt5.02□□□□□ -1.61
LSO1Q3E827 ADY4YLR227C 1482 nt5.02□□□□□ -1.61
LSO1Q3E827 RIM21YNL294C 1602 nt5.02□□□□□ -1.61
LSO1Q3E827 YER135CYER135C 393 nt5.02□□□□□ -1.61
LSO1Q3E827 YFL064CYFL064C 525 nt5.02□□□□□ -1.61
LSO1Q3E827 DAD2YKR083C 402 nt5.02□□□□□ -1.61
LSO1Q3E827 UBI4YLL039C 1146 nt5.02□□□□□ -1.61
LSO1Q3E827 CBC2YPL178W 627 nt5.02□□□□□ -1.61
LSO1Q3E827 ARC40YBR234C 1155 nt5.02□□□□□ -1.61
LSO1Q3E827 YBR285WYBR285W 435 nt5.02□□□□□ -1.61
LSO1Q3E827 CIT1YNR001C 1440 nt5.02□□□□□ -1.61
LSO1Q3E827 DAK1YML070W 1755 nt5.01□□□□□ -1.61
LSO1Q3E827 RAT1YOR048C 3021 nt5.01□□□□□ -1.61
LSO1Q3E827 SEC53YFL045C 765 nt5.01□□□□□ -1.61
LSO1Q3E827 YFR010W-AYFR010W-A 189 nt5.01□□□□□ -1.61
LSO1Q3E827 PAN6YIL145C 930 nt5.01□□□□□ -1.61
LSO1Q3E827 FLD1YLR404W 858 nt5.01□□□□□ -1.61
LSO1Q3E827 TPO2YGR138C 1845 nt5.01□□□□□ -1.61
LSO1Q3E827 MNT4YNR059W 1743 nt5□□□□□ -1.61
LSO1Q3E827 ORC6YHR118C 1308 nt5□□□□□ -1.61
LSO1Q3E827 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt5□□□□□ -1.61
LSO1Q3E827 YML108WYML108W 318 nt5□□□□□ -1.61
LSO1Q3E827 YBL044WYBL044W 369 nt5□□□□□ -1.61
LSO1Q3E827 RIO2YNL207W 1278 nt5□□□□□ -1.61
LSO1Q3E827 YOR392WYOR392W 444 nt5□□□□□ -1.61
LSO1Q3E827 AFT2YPL202C 1251 nt5□□□□□ -1.61
LSO1Q3E827 YBR062CYBR062C 543 nt5□□□□□ -1.61
LSO1Q3E827 PHO88YBR106W 567 nt5□□□□□ -1.61
LSO1Q3E827 YPL260WYPL260W 1656 nt4.99□□□□□ -1.61
LSO1Q3E827 PUF3YLL013C 2640 nt4.99□□□□□ -1.61
LSO1Q3E827 FOL1YNL256W 2475 nt4.99□□□□□ -1.61
LSO1Q3E827 ALG6YOR002W 1635 nt4.99□□□□□ -1.61
LSO1Q3E827 snR68snR68 136 nt4.99□□□□□ -1.61
LSO1Q3E827 VFA1YER128W 612 nt4.99□□□□□ -1.61
LSO1Q3E827 GRE2YOL151W 1029 nt4.99□□□□□ -1.61
LSO1Q3E827 DDP1YOR163W 567 nt4.99□□□□□ -1.61
LSO1Q3E827 YPR195CYPR195C 330 nt4.99□□□□□ -1.61
LSO1Q3E827 PGM2YMR105C 1710 nt4.99□□□□□ -1.61
LSO1Q3E827 MSC2YDR205W 2175 nt4.99□□□□□ -1.61
LSO1Q3E827 SSB1YDL229W 1842 nt4.99□□□□□ -1.61
LSO1Q3E827 SSB2YNL209W 1842 nt4.99□□□□□ -1.61
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