Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
TWISTNBQ3B726 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TWISTNBQ3B726 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms