Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
FHOD3Q2V2M9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
FHOD3Q2V2M9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
FHOD3Q2V2M9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
FHOD3Q2V2M9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
FHOD3Q2V2M9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
FHOD3Q2V2M9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
FHOD3Q2V2M9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
FHOD3Q2V2M9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
FHOD3Q2V2M9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
FHOD3Q2V2M9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
FHOD3Q2V2M9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
FHOD3Q2V2M9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
FHOD3Q2V2M9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
FHOD3Q2V2M9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
FHOD3Q2V2M9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
FHOD3Q2V2M9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
FHOD3Q2V2M9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC33.68■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC33.65■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
FHOD3Q2V2M9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
FHOD3Q2V2M9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
FHOD3Q2V2M9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
FHOD3Q2V2M9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
FHOD3Q2V2M9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
FHOD3Q2V2M9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
FHOD3Q2V2M9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
FHOD3Q2V2M9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
FHOD3Q2V2M9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
FHOD3Q2V2M9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
FHOD3Q2V2M9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
FHOD3Q2V2M9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
FHOD3Q2V2M9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
FHOD3Q2V2M9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms