Protein–RNA interactions for Protein: Q2QD12

RPEL1, Ribulose-phosphate 3-epimerase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPEL1Q2QD12 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
RPEL1Q2QD12 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPEL1Q2QD12 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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