Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Length 200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms