Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPROQ16827 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPROQ16827 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
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